Le raccolte conservate in museo riguardano in modo particolare le faune fossili del Pliocene e del Pleistocene rinvenute a più riprese nelle aree paleontologiche del settore orientale della provincia di Piacenza e lungo l’asse fluviale del Po.
Si tratta soprattutto di tre tipologie riguardanti la malacofauna del Piacenzano, i cetacei del Pliocene e i vertebrati del Quaternario padano. Sono raccolte in continuo incremento grazie a nuovi ritrovamenti ma anche all’acquisizione di collezioni consegnate da privati o enti.